在这部备受瞩目的影视作品中，逻辑漏洞犹如隐藏在暗处的陷阱，稍不留意便会让观众陷入困惑与不满之中。就拿剧中商业竞争的关键情节来说，女主何惟芳所经营的芳园正面临着竞争对手的恶意打压。那对手为了达到目的，竟不惜买通官府，以毫无根据的莫须有罪名对芳园进行查封。而女主在解决这一危机时，所采取的方式实在令人难以信服。她仅仅凭借一封匿名举报信，指出对手存在违法经营的问题，可这举报信中并无任何确凿证据。然而，官府却仿佛在处理儿戏一般，立刻撤销了对芳园的查封，转而对对手进行惩治。在古代那样严谨的官场环境下，如此办案方式实在是缺乏合理性，让人不禁对剧情的逻辑性产生质疑。
再将目光聚焦到男主蒋长扬身上，他身为花鸟使，肩负着调查宁王谋反线索的重任。在执行任务的过程中，他多次身处危险境地，却又总能全身而退，而其中的理由着实有些牵强。例如，有一次他在宁王府中不幸被发现行踪，本应陷入绝境，难以逃脱。但就在这时，宁王突然因为有事而离开，他便这样轻松地逃脱了。这种巧合救场的桥段在剧中被过度滥用，使得整个剧情充满了不合理的因素，让观众在观看时感到十分突兀。
不仅如此，该剧的剧情节奏也堪称一场“灾难”。在女主创办平价医药馆“悟庸堂”的情节中，原本这应该是一个能够充分展现女主成长历程以及她济世情怀的高光时刻。然而，剧组却花费了大量的篇幅去描述一些琐碎的细节。比如在选址时，女主与邻里之间产生的小摩擦，这些看似生活气息十足的情节，却在过多地堆积后，显得拖沓冗长。还有在招募郎中的过程中，各种繁琐的流程也被一一展现，足足用了三集的时间，“悟庸堂”才正式开业。这样的节奏，无疑让观众的耐心受到了极大的考验。
而男女主的感情线，更是陷入了常见的创作套路之中，毫无新意可言。从两人相识开始，到逐渐相恋，期间各种误会、冷战、和解的情节反复上演。整整五集的时间，都在围绕这些情感纠葛打转，主线剧情却停滞不前。观众在观看时，就像是在原地踏步，始终无法看到剧情有实质性的推进，久而久之，便会产生昏昏欲睡的感觉。
除此之外，支线剧情的喧宾夺主也成为了该剧的一大问题。一些配角的故事占用了过多的时长，比如女二和其青梅竹马之间的情感纠缠。这些情节与主线剧情的关联并不大，但却频繁地出现在剧中。这种情况不仅严重影响了剧情的连贯性，也让整个故事的节奏变得松散、拖沓，极大地降低了观众的观看体验。
